рекурсивная функция спускается по каталогу и переименовывает файлы с расширениемя из $ext_arr по маске 001.расширение

function my_rename($dirname)

{

    $ext_arr = array('jpeg', 'jpg', 'gif');

    $dir = opendir($dirname);

    $count = 1;

    while (($file = readdir($dir)) !== false) {

        if (is_file($dirname . '/' . $file)) {

            $info = pathinfo($dirname . '/' . $file);

            if (in_array(strtolower($info['extension']), $ext_arr)) {

                rename($dirname . '/' . $file, $dirname . '/' . str_pad($count, 3, '0', STR_PAD_LEFT) . '.' . strtolower($info['extension']));

                $count ++ ;

            }

        } elseif (is_dir($dirname . '/' . $file) && $file != '.' && $file != '..')my_rename($dirname . '/' . $file);

    }

    closedir($dir);

}